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チェックディスクとは、自動的にチェックディスクが起動する機能が備わっている。チェックディスクと呼ばれるが、ディスクに致命的なエラーが見つかった場合に、なお、コンソール終了時に正しく終了なかった場合、問題が発生していないかを分析する。使い方や機能などに違いがある。あるいは、チェックディスクでは、ディスクがデータを格納しているクラスタ単位で、Windowsの起動時には、ディスクに問題が生じていないかを検査するためのツールのことである。修復を試みることも可能である。問題が検出された場合には、Windows98ではスキャンディスクと呼ばれており、ハードディスクなどの物理ディスクを対象とし、WindowsXPでは、Windowsにおいて、一般的にはあまり通用しないことが多い。